超聲波清洗器是通過換能器，將功率超聲頻源的聲能轉換成機械振動，通過清洗槽壁將超聲波輻射到槽子中的清洗液。由于受到超聲波的輻射，使槽內液體中的微氣泡能夠在聲波的作用下從而保持振動。破壞污物與清洗件表面的吸附，引起污物層的疲勞破壞而被駁離，氣體型氣泡的振動對固體表面進行擦洗。
超聲波清洗機由于清潔力度大，清潔效果好，清潔精細的特點。被廣泛的應用于實驗室、鐘表、醫療等行業中。
實驗室中常用的東西其實是各種各樣不同的器皿，比如：燒杯、試管、錐形瓶等等。這些器皿擁有著不同的外形和形狀，這就導致它們在清洗時會比較困難。
使用實驗室超聲波清洗機時要求清洗液要浸沒被清洗物，而實驗室的器皿，比如大燒杯，它們是有一定的高度的，所以選擇實驗室超聲波清洗機的時候容積一定要選大一點的，這樣深度才夠。而且即便是小的實驗室，里面的器皿也不會少，容積大就可以同時清洗更多的器皿。
超聲波清洗機不僅僅有清洗的功能，它還可以用來脫氣和細胞破碎。而想要同時做到這些，單一頻率的超聲波清洗機是無法做到的，這時就需要一款雙頻的超聲波清洗機。28kHz可以用來細胞破碎和清洗較為頑固的污漬；50kHz可以用來尋常的清洗以及脫氣。
但要注意，物體清洗的效果在很大程度上和清洗劑有關，比如灰塵類的污垢，使用水就能清洗，油污的話就需要加入一些清洗劑了。還有的污垢尋常的清洗方式難以洗掉，這種污漬只會溶于特定的液體，比如我們常說的用汽油去洗機油。但是在超聲波清洗機里面是不被允許的，超聲波清洗機在工作時會產生熱量，使用可燃性液體作為清洗劑可能會引發起火甚至爆炸的危險。
